DIA采集方法的定性、定量质谱数据的分析,以及结果验证的统计学分析。
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产品介绍

和Scaffold产品线的其他软件类似,Scaffold DIA提供给用户友好的使用界面,提供结果报告及可共享的文件格式,并且为用户提供统计学分析。Scaffold DIA是基于帮助研究者完成基于DIA蛋白组学数据实验的蛋白鉴定、结果整合、总结、优化、定量和结果可视化的软件。

1. 一元化程序:从原始数据到结果
2. 可以搜索FASTA、DIA色谱图library或者Scaffold/Skyline导出的library
3. 不需要保留时间校正肽段
4. 直观的图形用户界面(GUI)
5. 可选择命令行接口

精确的碎片离子定量

使用碎片离子强度进行定量,避免来自母离子的干扰效应。Scaffold DIA进一步地利用碎片离子的峰型和cross-sample的一致性来获得更多的定量可信度。

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以蛋白质结果为中心的显示界面

蛋白水平的FDR是由Percolator计算来进行质控的。此外,可调节的蛋白质水平FDR和肽段计数,允许对数据阈值进行调整。通过统计显著性分析、GO分类条目、修饰等对数据进行过滤。


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灵活的复杂实验数据的整合

根据实验条件组织样本。定义组分、技术或生物学重复,并且也同时更新了Scaffold DIA统计学分析。
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GO分析帮助你深入研究生物学意义

通过在蛋白质鉴定中国添加GO条目来获取对生物学功能的研究。Scaffold DIA提供饼图和聚类图来帮助评估结果的生物学意义。



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包含主成分分析(PCA)的内置统计学分析

差异表达的视图和严格的统计检验得到的显著性,均由Scaffold DIA灵活的样品组织所管理。与PCA相结合,为探索性数据分析提供了理想的环境。交互型图形界面允许直接进行结果过滤,以及与其他视图整合。
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团队协作以及简化发表

你可以给同事共享Scaffold DIA的文件,可以用免费的Viewer软件来进行查看。Scaffold DIA同时还包含了Excel格式的结果数据导出,以及文章发表级别质量的图像,便于用户直接使用。


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