高性能虚拟化学合成引擎
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产品介绍

化学反应虚拟枚举是支持虚拟化合物库设计和组合化学的强大工具。Reactor是ChemAxon JChem技术中的支持广义反应方程式的虚拟反应枚举引擎,它结合了反应规则,可以生成化学意义上可能的产物,而不需预先选定试剂。Reactor可以执行高度自动化的反应枚举,也支持为给出的化学反应手动选择主要产物。

化学反应产物预测

用户桌面上的反应合成

Reactor是一个高性能的、可整合的反应枚举引擎。它通过输入的广义反应方程式进行运作,广义反应式可以通过各种不同的格式进行定义和导入,包括SMIRKS/SMARTS字符串, RDF, RXN 和MRV文件,或者在MarvinSketch中绘制。Reactor包括一个可直接使用的、庞大并不断增长的有机化学反应库,不需要再进行任何配置。

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定义用户的化学反应

通过广义反应方程式,Reactor可以在完全受控的情况下生成虚拟合成化合物库。在此过程中,用户可以直接绘制并修改反应物,从枚举输出的结果中通过他们的化学直觉即时选择有化学意义的产物。这种方式对于枚举产生集中型的化合物库非常有优势。


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通过合适的反应规则得到具有合成意义的分子
Reactor反应规则通过Chemical Terms(ChemAxon为化学信息学应用程序增加化学智能而设计的脚本语言)进行定义。通过Chemical Terms可以在反应规则中包括大量的计算属性来产生有效的化合物库。除了可以即时计算理化性质,Chemical Terms语言还支持从输入反应物文件中导入指定的数据字段,用于反应规则的定义和评价。

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智能而灵活的反应枚举


可识别立体化学的反应

Reactor反应式中可包括立体化学信息。Reactor能够灵活的处理四面体立体化学和双键立体化学。在Reactor的智能反应方案中,立体中心的反转和保留,cis-trans构型变化都可以进行正确的处理。从5.5版本开始前手性反应也得到了支持,用户可以操作syn/anti反应。

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化合物库设计

Reactor可执行简单的顺序枚举,这种情况下反应物按照它们在输入文件中的顺序依次进行相互的虚拟反应。Reactor也可以支持组合库枚举,产生虚拟的组合合成化合物库。用户还可以手动从枚举结果中去掉不想要的产物,或者限制反应枚举过程,将枚举结果限制在所需的主要产物。Reactor可以各种不同的输出格式来支持产物库或者反应库的生成。

建立丰富的分子库

Reactor可以将输入反应文件中的数据复制到枚举结果中,如溶解度,或者反应物的获取途径信息。而且Reactor可基于从反应式和反应物输入文件中提取的信息为每个反应生成合成编码。

访问简便性


向导式的用户界面

Reactore的独立运行版本提供一个简洁直观的图形用户界面,对反应枚举过程进行配置。这个用户界面引导用户一步一步的走过虚拟化学反应配置的全部流程。

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对不同平台的支持

Reactor可作为独立的应用程序运行,也可以整合到Instant JChem 和JChem for Excel中,还可以通过KNIME和Pileline Pilot工作流管理工具进行调用。作为独立的应用程序,它可以通过图形用户界面,也可以通过命令行来使用,或者通过Java API进行调用。Reactor具有完全的平台独立性,在Windows, Mac操作系统和Linux平台都可以运行。

创建并测试用户的反应

Reactor有内置的反应式绘图和编辑工具,用户可以创建自己的反应式并通过Chemical Terms脚本来添加相应的反应规则。通过Reactor整合的反应测试工具,可对所创建的反应式进行测试,对反应规则进行验证。

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