微阵列实验设计软件
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产品介绍

Array Designer 可以在几秒内设计成千上百用于SNP检测或表达研究的特异性寡核苷酸和用于cDNA 微阵列的PCR引物和探针。Array Designer支持检索、分析和存储数据,可以轻松研究整个生物体,包括检测全基因组中的每个基因或外显子,在个体或种群中表征转录组、发现差异表达和可变剪切的转录、进行SNP检测和分型、发现DNA序列变异以及进行比较基因组杂交分析。


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产品特性

  • 基因芯片表达分析

  • BLAST检索

  • SNP检测&SNP分型

  • 全基因组芯片分析

  • 覆瓦芯片分析

  • 再测序芯片分析


标准阵列设计

Array Designer支持在一次搜索中设计多个序列的SNP检测和基因表达分析引物和探针。我们的客户通常在一次搜索中选择超过10,000个序列。

全基因组阵列

Array Designer支持通过检测全基因组中每个基因或外显子,轻松地研究某个生物体的基因组成。这有利于在个体或种群和比较基因组杂交(CGH)中更简单地发现差异表达和可变剪接的转录本、SNPs、DNA序列变异。

覆瓦阵列设计(Tilling Arrays)

Array Designer支持聚焦全基因组序列中的每一个碱基,避免重复序列。调控元件表征,研究表观遗传修饰、甲基化模式和蛋白结合位点,这些在过去十分困难阵列设计现在都可以简单的完成。

重测序阵列设计(Resequencing Arrays)

Array Designer设计的重测序阵列可用于大量样品中的SNP及其他序列变异的检测。再测序阵列设计中的常见问题之一是由于模板内部杂交造成的碱基识别错误。由于BLAST的独特性能,Array Designer支持识别和避免会导致假阳性的同源区域。

NCBI数据库提供支持

在研究未公开或保密序列时,Array Designer支持在服务器端或PC端建立属于自己的本地数据库。

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