StarDrop是一个用于在药物发现中辅助决策、帮助项目组快速确定高质量化合物的软件。
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StarDrop是一个用于在药物发现中辅助决策、帮助项目组快速确定高质量化合物的软件。

StarDrop拥有全面的集成软件套件,在高度可视化和用户友好界面中提供计算模拟技术。

StarDrop可以通过预测模型实现从新数据到下一轮合成和研究决策的无缝流程,从而提高药物发现过程的速度、效率和产出率。

特点和优势

快速识别更有效的化合物

成功的化合物需要许多不同属性达到一个平衡。StarDrop 通过这种多参数优化的方法帮助您锁定最有潜力成功的化合物,使您能合成和测试更少的化合物,从而节约时间和财力。

有把握地进行决策

StarDrop能帮助您将药物发现数据中的内在不确定性考虑在内,从而避免错失有价值的潜在化合物。

优化您的化合物

StarDrop能通过高亮关键的构效关系来指导您进行化合物优化。

灵活的整合功能

StarDrop能与您的模型、信息学方法以及数据库进行无缝连接,为用户提供友好的访问这些资源的通道,使项目管理更快、更简单。

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    Multi-parameter Optimisation

    根据项目目标,使用概率评分严格评估化合物的成功潜力

    定义您研究项目所需的打分评价文件
    针对化合物进行评分以评估其成功可能性

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    Visualisation

    分析您的数据,高亮出 patterns,并识别出高质量的化合物

    在您项目的化学空间中寻找最优的化合物
    生成一个项目数据的交互式面板



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    SAR Analysis

    快速分析和探索您的系列化合物的构效关系

    为您的系列化合物创建交互式的SAR表

    推断官能团和属性之间的关系


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    Glowing Molecule™

    探索属性与结构之间的关系,然后根据即时反馈进行重新设计和优化

    重新设计分子以改善其属性

    观察结构变化对一个属性的影响



突破式数据交互

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    Sub-structure searching

    使用灵活和易于使用的子结构编辑器搜索化合物

    包括指定可变linker,以及可变原子和键的标准的独特能力。

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    Clustering

    对相似化合物进行聚类,在不同化合物的数据集中识别化学系列

    围绕hits分析SAR,从而对高通量筛选的结果进行分类

    或者找出具有良好性能或得分的化合物组。



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    Activity Cliffs
    分析完整的数据集的结构改变和属性变化趋势

    并确定结构最为相似的化合物

    同时用箭头标记属性的变化方向和程度

    帮助用户发现活性悬崖。

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    Matched Pair Analysis

    通过连接匹配的化合物对来评估化合物的转换

    以快速识别化合物发生了哪些取代
    以及它们对化合物属性的影响。



强大的整合功能

从StarDrop访问您的数据库

StarDrop与您的数据库无缝链接,从而使用户能更快、更方便地访问到项目数据:

● 连接到基于云的数据库和第三方中间设备

● 使用StarDrop的“刷新”功能,立即用最新数据更新StarDrop的分析

无缝链接到3D对接和比对模型

StarDrop的Pose Generation接口将您专业准备的3D模型与数据可视化、2D SAR分析和预测模型整合到一个单一、简洁的环境中。

● 实时评估多个3D设计迭代

● 与所有主要计算化学供应商兼容

将您的模型、脚本和流程方案直接与StarDrop整合与其他信息学平台进行交互,以补充StarDrop的功能:

● 使用内部或第三方模型进行预测

● 从其它平台如Pipeline Pilot™运行自定义脚本或流程方案

● 从您准备好数据的其它平台启动StarDrop来进行可视化和分析

链接到商业和公共数据库

● 寻找商业上可用的筛选化合物和building blocks

● 提取存储在ChEMBL、 PDB和PubChem中的化合物数据

从其它平台与StarDrop交互使用

StarDrop的许多功能也可以从其它平台访问:

● 使用StarDrop的模型进行预测

● 运行使用StarDrop的Auto-Modeller™模块自定义构建的模型

● 根据属性配置文件计算概率评分

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九大功能模块

根据用户需求,可以任意组合使用九大功能模块,实现复杂的计算模拟、代谢/毒性预测、分子对接、创意化合物生成和预测模型构建等功能。

计算模拟功能

ADME QSAR

模块内置了一系列关键ADME性质的高质量预测模型,用于评价小分子的ADME属性,所有的模型均通过毒理数据集严格验证,可以被Glowing Molecule调用指导化合物设计,也可以用于多参数评分,获得属性更为均衡的化合物。

Auto-Modeller™

利用多种先进的机器学习算法,Auto-Modeller模块能够自动构建和验证可靠的QSAR模型。构建的模型同样可被Glowing Molecule和多参数评分调用。

P450

通过量子化学模拟方法,P450模块能够预测化合物的一相代谢反应,为用户提供主要P450酶代谢亚型、代谢位点和代谢产物等全方位的代谢预测结果。

Derek Nexus™

Derek Nexus模块提供了Lhasa公司基于知识规则的毒性评估先进技术,来预测四十多种毒性风险;预测的同时,Derek也提供导致毒性的警示结构,从而帮助重新设计化合物。

创意生成功能

Nova™

通过三种化合物创意策略,帮助用户产生全新的化合物。生成化合物的同时,也可以使用多参数优化功能,实现定向的属性提升。

BIOSTER™

BIOSTER模块提供了27000多个生物类似转化反应,为Nova模块增加了海量的化学创意*。同时所有的化学转化反应均有文献可循,在虚拟创意阶段即兼顾合成经验。

* BIOSTER模块需要和Nova模块联合使用

3D设计功能

SeeSAR™

借助BioSolveIT的分子模拟技术,SeeSAR模块为用户带来全新的3D分子设计体验。SeeSAR模块包含三个子模块:SeeSAR Viewer提供了蛋白—分子的三维可视化视图,来鉴别产生亲和力的关键相互作用;SeeSAR Affinity使用HYDE打分方法来评估化合物的结合亲和力;SeeSAR Pose则利用FlexX对接方法来生成可供虚拟筛选和交互式3D设计的化合物构象。利用以上三个功能,用户可以从分子层面理解化合物的关键相互作用,改造化合物,提升活性。

torch3D™

torch3D模块帮助用户理解并应用 3D SAR来确认和优化新颖的化合物。通过torch3D模块,能够查看分子场,确认关键相互作用,比较化合物的分子场从而找到新颖的活性化合物。

多参数策略功能

MPO Explorer™

作为功能模块的专家模块,MPO模块帮助用户开发多参数优化策略。依托MPO模块,用户可以开发出适合项目目标的多参数评价规则,识别能分辨成功化合物的关键属性,甚至分析每个参数规则的设置是否稳健。

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